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Institut de
Recherche sur la
Biologie de l'
Insecte
 
 
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Personnel

Samuel
PICHON
Post-Doctorant
Equipe : ECEIS
Tél : 02 47 36 71 23

Compétences techniques :

 

Ecologie microbienne, interaction hôtes-parasites, microbiota (bactéries, virus, champignons), métabarcoding, génomique comparative, arthropodes (crustacés, hexapodes), biologie moléculaire, évolution.

Thématique de recherche :

 

 

 

 

 

 

Ma recherche vise à comprendre l'importance des microbes dans l'écologie et l'évolution de leurs hôtes.

 

 

 

 

Jusqu'à présent, j'ai identifié et caractérisé des gènes impliqués dans les interactions hôte-parasite afin de comprendre comment les bactéries évoluent et maintiennent des symbioses intimes dans les tissus d'arthropodes. Mon travail passé a examiné le système de sécrétion de type IV et les gènes ankyrines de la bactérie Wolbachia comme point d'interface entre les symbiontes et des crustacés terrestres isopodes.

 

 

 

 

 

 

J'ai également travaillé sur l'écologie et l'évolution du microbiote (communauté microbienne) des daphnies afin de comprendre les facteurs évolutifs qui façonnent la structure et déterminent la diversité apparente des bactéries associées à ces crustacés d'eaux douces.

 

 

 

 

 

Je travaille maintenant à caractériser la diversité des microbes intestinaux et leurs rôles dans le succès invasif des insectes xylophages.

 

Publications majeures :

 

Peer-reviewed papers

 

 

 

 

11- Mariadassou M, Pichon S and Ebert D (2015) Microbial ecosystems are dominated by specialist taxa. Ecology Letters, 18:974–982.

 

   

 

10- Birtel J, Walser J-C, Pichon S, Buergmann H and Matthews B (2015) Estimating bacterial diversity for ecological studies: methods, metrics, and assumptions. PLoS ONE, 10:e0125356.

 

  

 

09- Roulin A, Wu MMM, Pichon S, Arbore R, Kuehn-Buehlmann S, Kölliker M and Walser J-C (2014) De novo transcriptome assembly and validation in the European earwig (Dermaptera, Forficula auricularia). PLoS ONE, 9:e94098.

 

  

 

08- Boos S, Meunier J, Pichon S and Kölliker M (2014) Maternal care provides anti-fungal protection to eggs in the European earwigs. Behavioral Ecology, 25:754-761.

 

  

 

07- Pichon S, Bouchon D, Liu C, Chen L, Garrett RA and Grève P (2012) The expression of one ankyrin pk2 allele of the WO prophage is correlated with the Wolbachia feminizing effect in isopods. BMC Microbiology, 12:55.

  

06- Cordaux R, Pichon S, Ben Afia Hatira H, Doublet V, Grève P, Marcadé I, Braquart-Varnier C, Souty-Grosset C, Charfi-Cheikhrouha F and Bouchon D (2012) Widespread Wolbachia infection in terrestrial isopods and other crustaceans. ZooKeys, 176:123-131.

   

 

05- Pichon S, Bouchon D, Cordaux R, Chen L, Garrett RA and Grève P (2009) Conservation of the Type IV Secretion System throughout Wolbachia evolution. Biochemical and Biophysical Research Communications, 385:557-562.

 

  

04- Félix C, Pichon S, Braquart-Varnier C, Braig H, Chen L, Garrett RA, Martin G and Grève P (2008) Characterization and transcriptional analysis of two gene clusters for a type IV secretion machinery in Wolbachia of Armadillidium vulgare. Research in Microbiology, 159:481-485.

  

 

03- Cordaux R, Pichon S, Ling A, Pérez P, Delaunay C, Vavre F, Bouchon D and Grève P (2008) Intense transpositional activity of insertion sequences in an ancient obligate endosymbiont. Molecular Biology and Evolution, 25:1889-1896.

 

 

02- Serbielle C, Pichon S*, Chowdhury S*, Dupas S, Lesobre J, Purisima EO, Drezen J-M and Huguet E (2008) Adaptive evolution of a viral cystatin gene family involved in an insect host-parasitoid interaction. BMC Biology, 6:38.

  

 

01- Hanley ME, Franco M, Pichon S, Darvill B and Goulson D (2008) Breeding system, pollinator choice, and variation in pollen quality in British herbaceous plants. Functional Ecology, 22:592-598.

 

 

Popular science papers

  

Pichon S, Carré G, Morison N, Vaissière B, Lagier J and Longuesserre J (2005) Greenhouse UV-blocking plastic films: Bumblebees do not forage without UV. Cult. Leg., 85:24-28. (in French).

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